Wywodząca się z kontekstu historycznego sylwetka orła została zaprojektowana przez warszawskiego grafika Andrzeja Heidricha. Ostateczne zatwierdzenie wyglądu flagi herbowej województwa mazowieckiego nastąpiło w 2006 roku, a dokonała tego działająca przy Ministerstwie Spraw Wewnętrznych i Administracji Komisja Heraldyczna.
Flagę województwa umieszcza się przy lub na budynkach, w których znajdują się siedziby organów samorządu województwa oraz wojewódzkich samorządowych jednostek organizacyjnych. Flagę wywiesza się również w innych miejscach, dla podkreślenia doniosłego charakteru świąt państwowych i wojewódzkich, a także uroczystości lub rocznic tej rangi. Flaga województwa towarzyszy również dniom żałoby ogłoszonej przez władze państwowe lub wojewódzkie.Flaga to symbol, który nie tylko określa nas jako mieszkańców największego województwa w kraju, ale również jako Polaków i Europejczyków. Nasz region to silne województwo wielu szans i możliwości. Pokażmy, że jest dla nas ważne. Niech, 11 listopada biały orzeł bez korony na czerwonym tle zawiśnie przed naszymi domami, szkołami, na urzędach czy rynkach – mówi wicemarszałek Wiesław Raboszuk.